В Калининградской области принята и действует целевая программа Калининградской области «Основные направления поддержки малого и среднего предпринимательства в Калининградской области на 2009 - 2013 годы», утвержденная постановлением Правительства Калининградской области от 13 февраля 2007 года № 57 (далее - Программа).

В Программе обеспечение развития малого и среднего предпринимательства определено по следующим приоритетным направлениям, что нашло отражение в формулировании задач и мероприятий Программы:

1) инновационная деятельность;
2) услуги жилищно-коммунального хозяйства;
3) социальные услуги;
4) перерабатывающая промышленность;
5) янтарная отрасль;
6) туризм;
7) концессия.

Кроме этого, режим наибольшего благоприятствования устанавливается для субъектов малого и среднего предпринимательства, ориентированных на экспорт произведенной ими продукции и оказанных услуг.

Особое внимание уделяется поддержке и развитию малого и среднего предпринимательства в сфере инновационной деятельности, внедрению в промышленное производство перспективных высокотехнологичных разработок, упрощению процедуры выхода на региональные и международные рынки.

Программой предусмотрен необходимый комплекс мер поддержки проектов в сфере малого и среднего предпринимательства:

1) финансовая поддержка (субсидирование части затрат субъектов МСП, связанных с уплатой процентов по кредитам, привлеченным в российских кредитных организациях; субсидирование части затрат субъектов МСП по участию в выставочно-ярмарочных мероприятиях; субсидирование части затрат субъектов МСП на сертификацию для доступа на рынок Европейского Союза и соответствия международным стандартам; система гарантирования кредитов, займов и лизинговых отношений; субсидирование части затрат субъектов МСП на регистрацию субъекта МСП, безвозмездная субсидия на приобретение оборудования, аренду помещений, подключение к энергосетям в первый год деятельности; предоставление льготных микрозаймов субъектам МСП);

2) информационная поддержка (форумы, съезды, конференции, семинары, круглые столы и рабочие встречи по предпринимательству с целью повышения уровня знаний представителей МСП и обучения потенциальных предпринимателей основам ведения бизнеса, в том числе связанных с тематикой ВТО, использование учебных программ, информационно-методических материалов и учебных пособий для подготовки кадров;  оказание консультационных услуг (в том числе юридических и бухгалтерских услуг) субъектам МСП, инновационно-активным предприятиям, учреждениям социальной сферы и предприятиям ЖКХ в муниципальных образованиях Калининградской области);

3) подготовка кадров (обучение и повышение квалификации кадров, включая инновационно-активные предприятия, учреждения социальной сферы и предприятия ЖКХ).

Объемы финансирования Программы за счет средств областного бюджета на пятилетний период составил 302,925 млн. рублей, в том числе по годам:

-  на 2009 год - 67 млн. 277 тыс. руб.;
-  на 2010 год - 67 млн. 809 тыс. руб.;
-  на 2011 год - 55 млн. 581 тыс. руб.;
-  на 2012 год - 55 млн. 939 тыс. руб.;
-  на 2013 год - 56 млн. 319 тыс. руб.

В соответствии с приказами Министерства промышленности Калининградской области от 07 мая 2009 года № 1, 2, 3, 4 утверждены критерии отбора и требования к субъектам малого и среднего предпринимательства.

Постановлением Правительства Калининградской области от 17 марта 2008 года № 116 создано Государственное автономное учреждение Калининградской области «Фонд поддержки предпринимательства» (www.fpmp39.ru).

28 августа 2008 года подписано российско-датское Соглашение о партнерстве и сотрудничестве в рамках Датско-Российской программы содействия экономическому развитию Калининградской и Псковской областей, которым предусмотрено софинансирование гарантийного фонда за чет МИД Дании в размере 10 млн. рублей.

Кроме того принят Закон Калининградской области от 20 октября 2008 года № 278 «О государственной поддержке малого и среднего предпринимательства в Калининградской области».

Постановлением Правительства Калининградской области от 19 декабря 2008 года № 834 «О Совете по развитию малого и среднего предпринимательства Калининградской области» утвержден состав и положение Совета. Совет является совещательным органом в сфере развития малого и среднего предпринимательства и создан с целью интенсифицировать развитие предпринимательской деятельности, эффективно реализовывать государственную политику в сфере развития и поддержки малого и среднего предпринимательства в Калининградской области.

В соответствии с Протоколом о намерениях Правительства Калининградской области и ФГОУ «Российский государственный университет имени И. Канта» от 28 августа 2008 года ведется работа по созданию на базе РГУ им.И.Канта инновационного бизнес-инкубатора.